Calculadora de Peso Molecular de Proteínas

Categoria: Biologia
- April 04, 2025
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O peso molecular de uma proteína é calculado usando a soma das massas isotópicas médias de seus resíduos de aminoácidos:

\[ MW = \sum (n_i \times MW_i) - (n_{peptide} \times MW_{H_2O}) \]

Onde:

  • \(n_i\) = Número de cada aminoácido na sequência
  • \(MW_i\) = Peso molecular de cada aminoácido
  • \(n_{peptide}\) = Número total de ligações peptídicas
  • \(MW_{H_2O}\) = Peso molecular de uma molécula de água (18,02 Da)

O que é o Calculador de Peso Molecular de Proteínas?

O Calculador de Peso Molecular de Proteínas ajuda a determinar o peso molecular de uma proteína com base em sua sequência ou composição de aminoácidos. Ele também calcula propriedades adicionais, como ponto isoelétrico teórico (pI), coeficiente de extinção, hidrofobicidade (pontuação GRAVY) e carga líquida a pH 7.

Como Usar o Calculador

O calculador oferece várias maneiras de inserir dados de proteínas:

  • Método de Sequência: Insira a sequência da proteína usando códigos de aminoácidos de uma letra.
  • Método de Composição: Insira manualmente a contagem de cada aminoácido.
  • Opções Avançadas: Aplique modificações como acetilação, ligações dissulfeto ou modificações terminais.

Principais Recursos

  • Calcula o peso molecular em Dalton (Da) e quilodalton (kDa).
  • Determina o pI teórico com base nos valores de pKa dos aminoácidos.
  • Calcula o coeficiente de extinção para absorção UV a 280 nm.
  • Estima a hidrofobicidade usando a pontuação GRAVY.
  • Considera modificações personalizadas, como fosforilação, metilação e amidação.

Por que o Peso Molecular da Proteína é Importante?

Saber o peso molecular de uma proteína é crucial para:

  • Análise de eletroforese (SDS-PAGE, Western blotting).
  • Identificação por espectrometria de massa.
  • Purificação de proteínas e cromatografia.
  • Estudos estruturais e funcionais.

Perguntas Frequentes

Como é calculado o pI teórico?

O ponto isoelétrico (pI) é o pH em que a proteína não tem carga líquida. É calculado usando a equação de Henderson-Hasselbalch:

\[ pI = \frac{pKa_{pos} + pKa_{neg}}{2} \]

O que é o coeficiente de extinção?

O coeficiente de extinção é calculado usando o número de resíduos de triptofano (W), tirosina (Y) e cistina (C):

\[ \varepsilon = (n_W \times 5500) + (n_Y \times 1490) + (n_C \times 125) \]

Como o calculador lida com modificações?

O calculador permite que você aplique várias modificações pós-traducionais, que são adicionadas ou subtraídas do peso molecular da proteína.

O que é a pontuação GRAVY?

A Pontuação Média de Hidropatia (GRAVY) é uma medida da hidrofobicidade da proteína. É calculada como:

\[ GRAVY = \frac{\sum (Hidropatia_{AA} \times n_{AA})}{Total\ de\ Amino\ácidos} \]

Por que a molécula de água é incluída no cálculo?

Cada formação de ligação peptídica resulta na perda de uma molécula de água, portanto, a massa total é ajustada de acordo.

Conclusão

O Calculador de Peso Molecular de Proteínas é uma ferramenta valiosa para pesquisadores e estudantes em bioquímica e biologia molecular. Seja analisando a estrutura da proteína, realizando experimentos ou interpretando resultados, esta ferramenta fornece propriedades moleculares essenciais de forma rápida e precisa.